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La microbiota ocular se encuentra principalmente en la conjuntiva y está constituida por bacterias de los géneros <em>Staphylococcus corynebacterium</em> spp., <em>Bacillus</em> spp., <em>Neisseria</em> spp., <em>Moraxella</em> spp. y <em>Streptococcus</em> spp. Esta diversidad puede variar según las condiciones estacionales, la temperatura, la edad y la exposición ambiental. <em><strong>Objetivo</strong><em> caracterizar la diversidad de la microbiota residente y transitoria de la conjuntiva en adultos jóvenes. <em><strong>Metodología:</strong><em> estudio observacional descriptivo de corte transversal en 67 adultos jóvenes, hombres y mujeres entre 18 y 25 años de edad, que cumplieron con los criterios de inclusión y aceptaron firmar el consentimiento informado. A cada sujeto se le tomaron dos muestras del saco conjuntival, con un intervalo de una semana. Estas se cultivaron en agar sangre y agar chocolate a 37 °C por 24 horas. Las colonias aisladas se identificaron mediante el sistema automatizado VITEK. <em><strong>Resultados:</strong></em> se determinaron 16 géneros y 29 especies diferentes. El género más frecuente fue <em>Staphylococcus</em> (55,6 %), seguido de <em>Acinetobacter</em> (12,0 %), <em>Bacillus</em> (7,0 %), <em>Pasterella</em> (4,6 %) y <em>Escherichia</em> (3,7 %). La microbiota residente estuvo constituida principalmente por el género <em>Staphylococcus</em> y sus especies más representativas fueron <em>S.</em> <em>epidermidis</em> (50,0 %) y <em>S.</em> <em>lentus</em> (13,3 %). <em><strong>Conclusión:</strong><em> existe gran diversidad de bacterias en la microbiota conjuntival, mayor en la microbiota transitoria que en la residente probablemente, esto depende del ambiente en el que se encuentra el individuo.