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La citología de impresión conjuntival es un test no invasivo utilizado para la detección de xeroftalmia y deficiencia de vitamina A. <em><strong>Objetivo:</strong></em> determinar el porcentaje de niños con desnutrición, menores de cinco años que presentan anormalidad en la citología de impresión conjuntival, relacionada con la metaplasia escamosa. Métodos: se estudiaron 20 niños hospitalizados por desnutrición en la Unidad de Recuperación Nutricional del Hospital San Vicente de Paúl (Urrao, Antioquia), a quienes se les valoró el estado nutricional y se les realizó examen optométrico, test de secreción lagrimal básica, FBUT, tinción con Fluoresceína y dos citologías de impresión en la conjuntiva bulbar de cada ojo, antes y después del tratamiento nutricional. <em><strong>Resultados:</strong></em> la agudeza visual, oftalmoscopia, test de secreción lagrimal, y fluoresceína estuvieron dentro de los parámetros de normalidad en el 100% de los casos. El FBUT fue la única prueba clínica alterada, estuvo disminuido en el 75% de los pacientes. La citología de impresión se encontró anormal en el 57,5% de los ojos (23/40) considerando el grado límite de anormalidad y anormalidad, con una frecuencia de 27,5% y 30% respectivamente. Después del tratamiento nutricional el 50% de los ojos (20/40) tuvo algún grado de anormalidad en la citología de impresión: el 40% de los ojos estaba en el límite de anormalidad y el 10% anormal. <em><strong>Conclusiones:</strong></em> la citología de impresión conjuntival detectó un alto porcentaje de niños con metaplasia escamosa y disminución en la estabilidad de la película lagrimal. Después del tratamiento hubo una leve mejoría de los parámetros descritos. La citología de impresión detecta un alto porcentaje de niños con desnutrición que presentan alteraciones en el epitelio conjuntival, posiblemente por deficiencia de vitamina A.